Etant donné que la stratégie alternative de gestion du temps de pluie suggérée vise à promouvoir la récupération des eaux de pluie, la principale problématique environnementale à prendre en considération est d’abord, la qualité des eaux collectées.
Des eaux contaminées peuvent avoir des impacts négatifs sur les ressources en eau, les écosystèmes et le cadre de vie. A cet effet, une attention particulière doit être accordée aux précautions à mettre en place pour éviter un transfert massif de matières polluantes vers les nappes phréatiques et une stagnation prolongée de l’eau en surface. Aussi, explique des experts, les problèmes de santé publique liés à l’eau, sont à l’origine de beaucoup de décès en Afrique subsaharienne. D’autre part, les zones humides sahéliennes sont menacées de disparition sur le long terme. Pour ce faire, l’approche écosystème constitue l’outil de réflexion pertinent, car elle est basée sur une démarche transversale qui promeut une stratégie de gestion dans laquelle les ressources en eau sont considérées comme des systèmes dynamiques et intégrés du fait de l’interdépendance des éléments constitutifs d’un milieu.